Бактерии
Chlamydia psittaci (хламидия пситаки)
Chlamydia trachomatis (хламидия трахоматис)
Большинство бактерий участвуют в круговороте веществ в природе (формируют плодородие почвы, играют важнейшую роль в образовании полезных ископаемых и др), но не способны существовать и размножаться в среде организма высших животных Некоторые бактерии является неотъемлемым спутником человека и участником фундаментальных процессов его жизнедеятельности (формирование иммунитета, пищеварение и др) Нарушение нормального состава бактериального фона в организме (например, вследствие приема антибиотиков) приводит к развитию разнообразных патологических состояний. Некоторые виды бактерий при попадании в среду организма патогенны — то есть вызывают инфекционные болезни (обладают вирулентностью) и являются возбудителями многих тяжелых болезней: тифов, холеры, чумы, туберкулеза и множества других бактерий имеют различные геометрические формы, что нашло отражение в одном из подходов к их классификации, традиционно используемой в медицине (например, бактерии шаровидной формы — кокки, палочковидной — бациллы, клостридии, псевдомонады, извитые — вибрионы, спирохеты и тд
Общая масса микрофлоры кишечника составляет от 1 до 3 кг.Уникальность микрофлоры кишечника каждого человека позволяет рассматривать ее как своеобразные «отпечатки пальцев». При этом микрофлора кишечника здорового человека идеально адаптирована к потребностям именно его организма, и поэтому ее состав достаточно стабилен на протяжении всей жизни. Виды бактерий, которые преобладают в кишечнике, являются «хорошими», они сохраняют баланс и обеспечивают нормальную работу желудочно-кишечного тракта. При этом виды, которые вредны для организма, хотя и населяют микрофлору кишечника, не способны вызвать расстройство системы или заболевание. Однако под влиянием различных факторов (антибиотики, несбалансированное питание, инфекции и др.) баланс микрофлоры кишечника нарушается, патогенные виды бактерий разрастаются, их становится больше, а «хорошая» микрофлора кишечника угнетается. В этих случаях необходимо принять меры для восстановления нормального баланса микрофлоры кишечника, например, использовать специализированные медицинские препараты.
Микрофлора кишечника
Состав микрофлоры кишечника меняется в зависимости от различных уровней пищеварительной системы. Кроме того, на нее оказывают влияние и другие факторы, такие как возраст, пол, питание, образ жизни человека и т. п.
В желудочно-кишечном тракте бактерии распределены по-разному: в желудке рост микроорганизмов ограничивается кислой средой (низкий уровень рН), вдоль тонкой кишки их концентрация постепенно увеличивается, а наибольшее количество бактерий располагается в толстом кишечнике.
Бактерии, которые могут жить без кислорода (анаэробные), составляют 95% всей микрофлоры кишечника, тогда как бактерии, которым для жизни необходим кислород (аэробные), — всего 5%.
Рот, желудок, тонкая и толстая кишка — каждый из этих участков заселяют разные типы бактерий. Бактерии в полости рта выполняют защитную функцию (стрептококки, бактероиды, лактобактерии и дрожжи). Бактерии желудочно-кишечного тракта (лактобациллы, энтерококки, бактероиды и др.) — это невероятно сложный барьер на пути инфекций.
Формирование нормального состава микрофлоры кишечника — длительный и сложный процесс. Фактически с рождения человеческий организм начинают заселять различные микроорганизмы, на протяжении нескольких лет происходит созревание сбалансированного микромира. И хотя с возрастом количество и состав микроорганизмов меняется, уникальность и баланс микрофлоры кишечника сохраняется в течение всей жизни человека.
Классификация бактерий
Наибольшую известность получила фенотипическая классификация бактерий, основанная на строении их клеточной стенки, включённая, в частности.
Крупнейшими таксономическими группами в ней стали 4 отдела: Gracilicutes (тонкостенные грамотрицательные бактерии) с тремя классами: Scotobacteria (нефотосинтезирующие формы, например миксобактерии), Anoxyphotobacteria (не выделяющие кислорода фотосинтезирующие формы, например пурпурные серные бактерии) и Oxyphotobacteria (выделяющие кислород фотосинтезирующие формы, например цианобактерии), Firmicutes (толстостенные грамположительные бактерии) с двумя классами: Firmibacteria (формы с жесткой клеткой, например клостридии) и Thallobacteria (разветвленные формы, например актиномицеты), Tenericutes (грамотрицательные бактерии без клеточной стенки) с классом Mollicutes (формы с мягкой клеткой, например микоплазмы) и Mendosicutes (археи) с классом Archaebacteria (древние формы, например метанобразующие).
В последнее время всё большее развитие получает филогенетическая классификация бактерий, основанная на данных молекулярной биологии. Одним из первых методов оценки родства по сходству генома был предложенный ещё в 1960-х годах метод сравнения содержания гуанина и цитозина в ДНК. Хотя одинаковые значения их содержания и не могут дать никакой информации об эволюционной близости организмов, их различия на 10 % означают, что бактерии не принадлежат к одному роду. Другим методом, произведшим в 1970-е настоящую революцию в микробиологии, стал анализ последовательности генов в 16s рРНК, который позволил выделить несколько филогенетических ветвей эубактерий и оценить связи между ними.
Для классификации на уровне вида применяется метод ДНК-ДНК гибридизации. Анализ выборки хорошо изученных видов позволяет считать что 70 % уровень гибридизации характеризует один вид, 10-60 % — один род, менее 10 % — разные рода. Филогенетическая классификация отчасти повторяет фенотипическую, так, группа Gracilicutes присутствует и в той и в другой. В то же время систематика грамотрицательных бактерий была полностью пересмотрена, архебактерии и вовсе выделены в самостоятельный таксон высшего ранга, часть таксономических групп разбита на части и перегруппирована, в одни группы объединены организмы с совершенно разными экологическими функциями, что вызывает ряд неудобств и недовольство части научного сообщества. Объектом нареканий становится и то, что проводится фактически классификация молекул, а не организмов.
